Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Apbb1Q9QXJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Apbb1Q9QXJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apbb1Q9QXJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Apbb1Q9QXJ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms