Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer2Q9QWW1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer2Q9QWW1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer2Q9QWW1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer2Q9QWW1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Homer2Q9QWW1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms