Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai2Q9QVY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rai2Q9QVY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rai2Q9QVY8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rai2Q9QVY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms