Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk1eQ9JMK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csnk1eQ9JMK2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnk1eQ9JMK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms