Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hdgfl3Q9JMG7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl3Q9JMG7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl3Q9JMG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl3Q9JMG7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms