Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ap3b2Q9JME5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ap3b2Q9JME5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ap3b2Q9JME5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap3b2Q9JME5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ap3b2Q9JME5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ap3b2Q9JME5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms