Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLY0

Socs6, Suppressor of cytokine signaling 6, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs6Q9JLY0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Socs6Q9JLY0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Socs6Q9JLY0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Socs6Q9JLY0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms