Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col5a3Q9JLI2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col5a3Q9JLI2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col5a3Q9JLI2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col5a3Q9JLI2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col5a3Q9JLI2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col5a3Q9JLI2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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