Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx5Q9JL61 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx5Q9JL61 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfx5Q9JL61 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx5Q9JL61 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx5Q9JL61 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms