Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alyref2Q9JJW6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Alyref2Q9JJW6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alyref2Q9JJW6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alyref2Q9JJW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms