Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bgrlQ9JJU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bgrlQ9JJU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms