Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Riox1Q9JJF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Riox1Q9JJF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Riox1Q9JJF3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riox1Q9JJF3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms