Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a4Q9JIS8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc12a4Q9JIS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc12a4Q9JIS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms