Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pus3Q9JI38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pus3Q9JI38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pus3Q9JI38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pus3Q9JI38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pus3Q9JI38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms