Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zcchc17Q9ESX4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zcchc17Q9ESX4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zcchc17Q9ESX4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zcchc17Q9ESX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zcchc17Q9ESX4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zcchc17Q9ESX4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zcchc17Q9ESX4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zcchc17Q9ESX4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms