Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek6Q9ES70 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek6Q9ES70 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek6Q9ES70 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek6Q9ES70 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek6Q9ES70 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek6Q9ES70 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek6Q9ES70 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nek6Q9ES70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms