Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc4Q9ES56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc4Q9ES56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc4Q9ES56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms