Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Erg28Q9ERY9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Erg28Q9ERY9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Erg28Q9ERY9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Erg28Q9ERY9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms