Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sall1Q9ER74 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sall1Q9ER74 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sall1Q9ER74 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms