Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tor1bQ9ER41 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tor1bQ9ER41 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1bQ9ER41 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tor1bQ9ER41 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tor1bQ9ER41 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms