Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SgshQ9EQ08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SgshQ9EQ08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SgshQ9EQ08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SgshQ9EQ08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms