Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgn3Q9DCB1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgn3Q9DCB1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgn3Q9DCB1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgn3Q9DCB1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms