Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyp27a1Q9DBG1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cyp27a1Q9DBG1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp27a1Q9DBG1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyp27a1Q9DBG1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms