Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgf29Q9DA08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sgf29Q9DA08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sgf29Q9DA08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms