Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Subh2bvQ9D9Z7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms