Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700109H08RikQ9D9C0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700109H08RikQ9D9C0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700109H08RikQ9D9C0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms