Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700123K08RikQ9D991 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700123K08RikQ9D991 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700123K08RikQ9D991 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
1700123K08RikQ9D991 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700123K08RikQ9D991 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms