Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jam3Q9D8B7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Jam3Q9D8B7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jam3Q9D8B7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms