Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gins2Q9D600 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gins2Q9D600 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gins2Q9D600 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gins2Q9D600 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gins2Q9D600 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gins2Q9D600 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gins2Q9D600 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gins2Q9D600 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms