Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3404Q9D506 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm3404Q9D506 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm3404Q9D506 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3404Q9D506 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms