Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc105Q9D4K7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc105Q9D4K7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc105Q9D4K7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc105Q9D4K7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms