Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UvssaQ9D479 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UvssaQ9D479 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UvssaQ9D479 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UvssaQ9D479 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UvssaQ9D479 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UvssaQ9D479 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms