Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
4933428G20RikQ9D3X4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms