Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim42Q9D2H5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim42Q9D2H5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms