Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc8bQ9D2D9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhdc8bQ9D2D9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Klhdc8bQ9D2D9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhdc8bQ9D2D9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc8bQ9D2D9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms