Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D1K7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D1K7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9D1K7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D1K7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D1K7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D1K7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D1K7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D1K7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms