Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D1F3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D1F3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D1F3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9D1F3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q9D1F3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9D1F3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q9D1F3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D1F3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D1F3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D1F3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D1F3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D1F3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D1F3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D1F3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D1F3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms