Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MtrexQ9CZU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MtrexQ9CZU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MtrexQ9CZU3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MtrexQ9CZU3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MtrexQ9CZU3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MtrexQ9CZU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms