Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm8Q9CXT6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm8Q9CXT6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm8Q9CXT6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm8Q9CXT6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm8Q9CXT6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm8Q9CXT6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms