Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc17Q9CXD9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc17Q9CXD9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc17Q9CXD9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc17Q9CXD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc17Q9CXD9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms