Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb2bQ9CWF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tubb2bQ9CWF2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb2bQ9CWF2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms