Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NubplQ9CWD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NubplQ9CWD8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NubplQ9CWD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms