Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atxn3Q9CVD2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atxn3Q9CVD2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atxn3Q9CVD2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atxn3Q9CVD2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms