Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tm7sf3Q9CRG1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tm7sf3Q9CRG1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tm7sf3Q9CRG1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms