Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pop4Q9CR08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop4Q9CR08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop4Q9CR08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms