Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb5Q9CQH3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndufb5Q9CQH3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufb5Q9CQH3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufb5Q9CQH3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb5Q9CQH3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms