Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms