Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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