Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9CQC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CQC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q9CQC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9CQC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CQC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q9CQC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CQC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CQC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CQC3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CQC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CQC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CQC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CQC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CQC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms