Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ncbp2Q9CQ49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncbp2Q9CQ49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncbp2Q9CQ49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms